Omamori Himari raconte l'histoire d'un lycéen de 16 ans nommé Yuto Amakama, allergique aux chats, celui-ci est protégé par un talisman mais aussi par un esprit représenté sous la forme d'une jolie demoiselle maniant le katana, Himari. Elle a néanmoins une particularité : c'est une fille-chat.